More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  87.27 
 
 		 389 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  89.09 
 
 		 389 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  74.94 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  75.58 
 
 		 388 aa  591  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  65.19 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  63.35 
 
 		 381 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  63.35 
 
 		 380 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  62.3 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  60.57 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 		 384 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  58.66 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  59.13 
 
 		 387 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  57.62 
 
 		 383 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  59.01 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  59.01 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  58.49 
 
 		 382 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  56.48 
 
 		 383 aa  454  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  56.54 
 
 		 381 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  56.07 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  54.26 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  54.03 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  49.61 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.92 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  29 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.82 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  31.5 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  29.23 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  26.46 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  29.23 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  29.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  29.71 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  29.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  29.23 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  33.6 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  29.23 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.66 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.06 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  26.18 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  32 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  27.92 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  27.69 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.55 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  33.93 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  29.23 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.55 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.79 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.79 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>