More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 
153 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  71.67 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 
156 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 
132 aa  136  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
147 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
130 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 
124 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 
144 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
291 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  44.83 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  44.03 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
167 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
200 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  38.46 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44.74 
 
 
570 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  40.57 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.09 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.98 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  32.85 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.28 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.52 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
334 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.8 
 
 
363 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.52 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.09 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.14 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  34.51 
 
 
352 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.85 
 
 
352 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.91 
 
 
352 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.7 
 
 
396 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
206 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.53 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.71 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  31.82 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.89 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.52 
 
 
360 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.05 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.9 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.05 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.05 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.39 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.03 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.3 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.35 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  31.07 
 
 
399 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40.77 
 
 
329 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40.77 
 
 
329 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.3 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  51.52 
 
 
320 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.78 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.17 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
244 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.35 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 
310 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>