116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3385 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  63.09 
 
 		 846 aa  1099    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 839 aa  1736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  90.01 
 
 		 849 aa  1571    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  46.61 
 
 		 1084 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  42.96 
 
 		 811 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.39 
 
 		 955 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.39 
 
 		 986 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.39 
 
 		 986 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.39 
 
 		 986 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.14 
 
 		 955 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  35.26 
 
 		 986 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  35.14 
 
 		 986 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  36.15 
 
 		 961 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  35.14 
 
 		 964 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  36.22 
 
 		 1189 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.34 
 
 		 827 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 1089 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  34.18 
 
 		 877 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.21 
 
 		 899 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33.58 
 
 		 890 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  32.61 
 
 		 1075 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.24 
 
 		 784 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  29.03 
 
 		 785 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  35.21 
 
 		 1465 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.11 
 
 		 823 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.94 
 
 		 819 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  30.94 
 
 		 819 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  30.94 
 
 		 819 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  30.58 
 
 		 821 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  29.68 
 
 		 761 aa  296  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  30.23 
 
 		 775 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  28.32 
 
 		 753 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 		 771 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  29.59 
 
 		 759 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.73 
 
 		 749 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  27.84 
 
 		 778 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  27.82 
 
 		 807 aa  287  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 		 745 aa  284  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  29.63 
 
 		 747 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 760 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 777 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  31.73 
 
 		 740 aa  276  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  27.85 
 
 		 742 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 784 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.14 
 
 		 771 aa  268  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.93 
 
 		 769 aa  269  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 		 762 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  29.32 
 
 		 790 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  29.14 
 
 		 790 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  30.1 
 
 		 754 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 		 757 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  26.82 
 
 		 976 aa  255  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.32 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  27.26 
 
 		 747 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  27.43 
 
 		 769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  26.7 
 
 		 759 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  25.61 
 
 		 772 aa  240  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 		 774 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  29.32 
 
 		 773 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  26.61 
 
 		 754 aa  237  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.5 
 
 		 771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  26.59 
 
 		 758 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.9 
 
 		 900 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  27.9 
 
 		 900 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  26.84 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  27.38 
 
 		 782 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  27.79 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  27.02 
 
 		 1322 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.55 
 
 		 900 aa  224  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.39 
 
 		 1114 aa  224  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  27.38 
 
 		 755 aa  220  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  26.51 
 
 		 706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.71 
 
 		 781 aa  218  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  27.05 
 
 		 806 aa  218  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  26.13 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  26.79 
 
 		 808 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  25.84 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  24.85 
 
 		 780 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.3 
 
 		 1124 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  26.99 
 
 		 797 aa  210  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  24.55 
 
 		 888 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  31.29 
 
 		 716 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  26.76 
 
 		 1427 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  27.03 
 
 		 1422 aa  205  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  25.32 
 
 		 760 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  25 
 
 		 886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  25 
 
 		 886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  25 
 
 		 886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.16 
 
 		 1426 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  26.53 
 
 		 764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.47 
 
 		 757 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  25.25 
 
 		 798 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  26.33 
 
 		 771 aa  190  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  23.92 
 
 		 802 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  27.41 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_002950  PG1711  alpha-1,2-mannosidase family protein  26.91 
 
 		 753 aa  182  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.66 
 
 		 751 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03054  alpha-1,2-mannosidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G10520)  24.65 
 
 		 821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00600  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.25 
 
 		 912 aa  171  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  23.65 
 
 		 943 aa  171  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>