More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2927 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  87.03 
 
 		 372 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  87.12 
 
 		 367 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 370 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  76.58 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  66.58 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  66.85 
 
 		 368 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  66.58 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  66.13 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  65.57 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  49.1 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  52.3 
 
 		 351 aa  358  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  49.86 
 
 		 351 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.37 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  45.31 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  48.39 
 
 		 357 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  45.45 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.62 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  41.95 
 
 		 336 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  41.99 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  40.49 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  41.88 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  38.57 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  39.55 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  37.92 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  38.14 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  37.01 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  38.48 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  38.48 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  37.92 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  37.85 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  38.14 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  38.14 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  38.14 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  37.29 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  37.75 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  37.18 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  36.9 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  37.75 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  58.6 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  35.81 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  37.15 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  49.74 
 
 		 347 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.94 
 
 		 395 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  34.63 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.97 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  47.27 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  31.4 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  30.58 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  55.64 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  29.78 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.86 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  34.4 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  52.63 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  31.13 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  46.67 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  56.45 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  49.59 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  45.77 
 
 		 190 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.46 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.36 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  37.5 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.9 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  38.22 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  27.05 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  26.69 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.9 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  34.27 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  35.54 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  35.98 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  38.36 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  34.16 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  28.92 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.93 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  37.65 
 
 		 322 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.93 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.93 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  32.61 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.27 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  31.98 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  38.04 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.93 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>