More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2205 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 392 aa  798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  73.99 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  71.32 
 
 		 407 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 407 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  66.25 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2350  AraC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 130 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2125  helix-turn-helix domain-containing protein  73.68 
 
 		 130 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2234  helix-turn-helix domain-containing protein  77.78 
 
 		 99 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3244  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3991  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4002  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02396  transcriptional regulator, AraC family protein  29.77 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.372972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  27.09 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2932  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1537  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  46.25 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1471  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1531  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00128514  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  21.56 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  35.92 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  35.92 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  36.96 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  23.14 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.26 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>