More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3991 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3991  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 353 aa  727    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3244  transcriptional regulator, AraC family  31.04 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  26.7 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  28.81 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  28.42 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02396  transcriptional regulator, AraC family protein  25.14 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.372972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4002  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  24.72 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  24.91 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  23.49 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2601  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0251856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0428  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  30.71 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  22.95 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  24.93 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  25.87 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  24.93 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  22.42 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2406  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0741804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2125  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2902  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000829875  normal  0.0371482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  25.39 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  21.75 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2350  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  22.18 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2234  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  24.56 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1656  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359761  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  22.26 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>