More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 344 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3244  transcriptional regulator, AraC family  60.77 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4002  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3991  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02396  transcriptional regulator, AraC family protein  30.97 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.372972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  29.45 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.23 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 407 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  28.83 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 347 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.77 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.67 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.17 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2125  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  23.47 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>