More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3244 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3244  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 345 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  60.77 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4002  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3991  AraC family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02396  transcriptional regulator, AraC family protein  29.04 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.372972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2113  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0135446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  27.91 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  27.3 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.16 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  24.7 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 364 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  23.38 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4239  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.93 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.02 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.3 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  22.54 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>