278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2712 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  100 
 
 		 309 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  51.68 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  48.84 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  48.68 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  47.68 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  43.14 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  44.48 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  44.67 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  43.93 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  43.75 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  36.21 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  34.33 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  33.67 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  33 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  35.53 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  30.67 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  31.4 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  27.04 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  29.58 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  28.06 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  28.06 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  31.54 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.11 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.2 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  40.97 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  35 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  31.23 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  27.92 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  32.85 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  26.76 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.58 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  29.7 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  22.95 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  30.71 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  30.04 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  27.69 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  29.58 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  26.28 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  37.09 
 
 		 1010 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  28.12 
 
 		 451 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  28.88 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  27.24 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  28.47 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.22 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  29.56 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  27.24 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  29.51 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  30.92 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  27 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  28.04 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  28.76 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  28.86 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  24.84 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  27.55 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  26.65 
 
 		 868 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  35.88 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  30.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 876 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  26.62 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  27.53 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  27 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  27.11 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.34 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  23.05 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  25.25 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  26.86 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  30.04 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.52 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  27.45 
 
 		 897 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  27.05 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  28.64 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  27.27 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  28.64 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  35.77 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  25.62 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  35.77 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.07 
 
 		 866 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  27.8 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  35.37 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  26.76 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>