More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2491 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 391 aa  806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  76.34 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  76.08 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  76.08 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  76.08 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  75.06 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  75.32 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  73.52 
 
 		 392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  74.55 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  74.3 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  74.05 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  73.51 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  73.4 
 
 		 392 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  73.01 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  73.01 
 
 		 392 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  71.65 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  63.38 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  55.24 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  51.8 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  51.28 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  52.47 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  50.77 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  48.97 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  48.97 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  48.97 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  48.71 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  48.71 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  49.48 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  46.68 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  49.09 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.48 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  43.73 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.96 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.96 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  47.07 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.69 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.7 
 
 		 408 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.99 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.92 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.65 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.94 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  45.96 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.9 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.04 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.9 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.46 
 
 		 393 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.49 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  44.04 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.56 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 377 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 377 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.94 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  44.16 
 
 		 401 aa  329  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  40.21 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.68 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  44.07 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.93 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  45.88 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.95 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.24 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.49 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  43.46 
 
 		 381 aa  322  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  42.3 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.47 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  45.93 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.01 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>