More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22950  Mg-dependent DNase  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00452809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  56.72 
 
 		 275 aa  222  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0618  TatD-related deoxyribonuclease  44.34 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.189255 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02480  Mg-dependent DNase  37.84 
 
 		 319 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.03042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  38.59 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  38.81 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  36.87 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  33.8 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  36.32 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  33.8 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2167  TatD-related deoxyribonuclease  34.63 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  36.31 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  32.86 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  32.67 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  32.31 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  32.21 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  30.45 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  27.94 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  27.31 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  30.14 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  30.62 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  25.49 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64467  predicted protein  27.53 
 
 		 414 aa  72  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  30.71 
 
 		 259 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  31.34 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  27.57 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  32.38 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  30.38 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  28.16 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  31.31 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  31.46 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  30.38 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  33.47 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  29.81 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  31.75 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  30 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  27.96 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  24.88 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  29.52 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  31.54 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  32.2 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  32.23 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  26.15 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  23.81 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  28.57 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  29.87 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  27.44 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  33.81 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  30.66 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  30.77 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  25.9 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  22.61 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  25.76 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  28.35 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  25.86 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  30.19 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  33.64 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  29 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  27.13 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  28.85 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  27.57 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  31.73 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  26.45 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  26.83 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  29.36 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  23.53 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  31.58 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  26.83 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  26.09 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  26.83 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  31.63 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  22.18 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  27.94 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  30.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  26.83 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  27.04 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.37 
 
 		 464 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  30.41 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  26.32 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  26.64 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  25.48 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  22.22 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  30.59 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  31.68 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  29.58 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  25.2 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  25.78 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  22.22 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  27.64 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>