228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04590  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  100 
 
 		 430 aa  879    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00333842  hitchhiker  0.0000000448049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2176  trigger factor domain protein  34.15 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  30.7 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  29.27 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  25.82 
 
 		 501 aa  99.8  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  25.84 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  22.2 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  24.74 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  21.1 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  24.67 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  26.97 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  24.8 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  24.81 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  21.5 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  23.21 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  23.63 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  24.77 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  23.33 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  20.92 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  21.5 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  22.55 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  22.92 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  22.92 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  21.85 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  23.65 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  23.22 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11720  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  24.82 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  24.26 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  23.77 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  23.13 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  23.33 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  23.83 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  24.25 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  24.73 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  25.42 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  25.4 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  22.22 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  22.48 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  23.19 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  23.41 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  24.66 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0761  trigger factor  23.11 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  21.64 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  23.05 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  20.7 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  24.25 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  23.88 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  23.57 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  21.6 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  21.75 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  21.46 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  24.46 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  23.84 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  23.13 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  22.75 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  24.6 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  23.13 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  22.26 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  21.54 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  23.02 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  21.54 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  21.54 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  25.38 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  22.68 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  22.22 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  22.72 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  20.81 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  24.14 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  22.51 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  24.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  22.77 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  24.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  24.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  24.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  24.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  24.35 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  24.24 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  22.98 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  23.19 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  20.62 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  25.08 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  20.44 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  20.94 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  22.05 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  19.77 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  20.08 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  23.45 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>