More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3219 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  48.68 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  44.59 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  46.67 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  39.74 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.19 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  50.72 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.74 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  38.36 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  40.85 
 
 		 383 aa  63.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  44.87 
 
 		 391 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  39.19 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  37.84 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  38.96 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  36.25 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  44.78 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.84 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  45.45 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  36.49 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  36.49 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  35.14 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  41.79 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  43.84 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  38.46 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  44.44 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  37.84 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  41.54 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  47.27 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  40.91 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  38.67 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  36 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  39.66 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  40 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  40.28 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  40.28 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  39.39 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  36.84 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  41.56 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.39 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  38.96 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  37.33 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  30.3 
 
 		 442 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  33.33 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  42.37 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  32.88 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  36.59 
 
 		 398 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  32 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  40.51 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.85 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  37.68 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  40.26 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  33.33 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  39.71 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  40 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  36.23 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.84 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  26.67 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  38.81 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  39.06 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  34.25 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  45.45 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>