152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3859 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  74.41 
 
 		 472 aa  697    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  100 
 
 		 478 aa  984    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  77.85 
 
 		 509 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  66.74 
 
 		 459 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  63.43 
 
 		 468 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  62.14 
 
 		 456 aa  569  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  55.84 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  47.56 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  45.79 
 
 		 455 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  42.07 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  40.6 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.72 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  25.75 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  25.31 
 
 		 625 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  26.12 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  27.07 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  30.21 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  31.22 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  31.28 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  31 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  32 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  26.15 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  30.9 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  30.9 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  33.15 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  36.5 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.91 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  29.91 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  30.9 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  30.9 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  30.9 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  30.34 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  30.9 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  33.15 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  33.15 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.44 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.27 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.87 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  26.22 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  36.54 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  30.72 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  26.22 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  32.58 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.65 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.95 
 
 		 528 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  27.06 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.36 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  26.97 
 
 		 325 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  27.88 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  27.55 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  25.64 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  24.34 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  26.36 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  34.38 
 
 		 536 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.97 
 
 		 541 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.11 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.77 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  34.38 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.79 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  31.73 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  33.12 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.75 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.25 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  35.19 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  25.26 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  28.86 
 
 		 550 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.29 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.32 
 
 		 559 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  35.71 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  40.51 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  34.82 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  24.81 
 
 		 334 aa  50.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  21.52 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  24.41 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  35.58 
 
 		 539 aa  50.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  25.48 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  34.62 
 
 		 323 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  29.61 
 
 		 397 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  32.17 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.21 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.08 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  34.96 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  23.72 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  34.23 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  27.32 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  27.48 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.83 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  30.51 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  33.02 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.83 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  28 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  24.32 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  38.89 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.32 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>