More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0578 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 163 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  74.47 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 163 aa  220  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  74.07 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  72.86 
 
 		 165 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  73.43 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  71.83 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 165 aa  213  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  72.73 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 165 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 168 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  69.06 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  64.79 
 
 		 152 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  64.08 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  51.15 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  52.67 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  54.26 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  52.67 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  54.26 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  52.67 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  48.61 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 141 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  51.91 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.54 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  50.76 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 150 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 150 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  53.6 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.96 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  51.56 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.29 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.29 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  47.29 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  43.41 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  54.03 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.15 
 
 		 152 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  43.71 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  51.69 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  51.69 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 143 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 		 145 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  48.03 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  48.55 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  51.91 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.04 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>