243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0520 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  75.29 
 
 		 178 aa  263  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  66.67 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  64.74 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  64.74 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  65.5 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  63.35 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  69.29 
 
 		 150 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  57.49 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  49.16 
 
 		 197 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  48.88 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  44.24 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  39.05 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  42.18 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  39.1 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  31.89 
 
 		 200 aa  84.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  36.09 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  29.55 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  29.55 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  29.36 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  58.18 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  34.31 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 282 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 306 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 305 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 269 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 322 aa  52  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  36 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.31 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  34.67 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  35.14 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  36.26 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.56 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 316 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.57 
 
 		 351 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 345 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 593 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.01 
 
 		 288 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.34 
 
 		 276 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.74 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 278 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  26.42 
 
 		 261 aa  48.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 291 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.74 
 
 		 289 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  26.11 
 
 		 377 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.01 
 
 		 288 aa  47.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  21.88 
 
 		 199 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  32.56 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  26.53 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  29.73 
 
 		 275 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 294 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.26 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 374 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  26.57 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  27.87 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 		 293 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 356 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  27.13 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.86 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 374 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>