174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0335 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0335  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3697  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0327  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  27.64 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  25.12 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  22.99 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  26.37 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  22.35 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  21.99 
 
 		 264 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  25.87 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  26.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  27.35 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  25.32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  25.32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  25.32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  25.32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  25.32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  25.71 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  25.71 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  23.93 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  29.91 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  27.35 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  24.68 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  24.79 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  27.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  23.93 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  25 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  25.14 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  23.24 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  22.41 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  22.95 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  21.67 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  22.76 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  18.81 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  22.7 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  24.26 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  30.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  24 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2900  electron transport protein SCO1/SenC  25.19 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  24.39 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  23.81 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1399  electron transport protein SCO1/SenC  26.14 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  22.07 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  25.64 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  24.48 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  23.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  21.05 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  22.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  25.77 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  26.71 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  21.64 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  26.97 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  26.61 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  27.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  29.21 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2235  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  22.9 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  23.13 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  23.58 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  22.67 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  22.54 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  36.11 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  23.53 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  22.27 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  36.11 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  23.13 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  36.84 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  22.76 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  22.76 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  24.58 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  24.81 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  22.06 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  22.09 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  24.03 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  26.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  20.11 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  23.02 
 
 		 247 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  22.46 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  22.83 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  25.62 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  20.25 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  23.29 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  22.88 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  21.93 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  21.05 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  22.08 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  19.87 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  25.81 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
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BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.43 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  22.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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