More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2217 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  100 
 
 		 327 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  67.43 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  64.85 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  52.79 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  50.81 
 
 		 310 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  49.16 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  50.17 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  48.86 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  43.92 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  42.52 
 
 		 301 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  42.96 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  43.05 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  42.33 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  42.56 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  41.37 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  42.23 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.84 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  42.57 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.86 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  41.12 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  43.45 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  40.2 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  40.2 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  40.47 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.96 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  41.64 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  41.64 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  41.23 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 747 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  40.91 
 
 		 348 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  44.04 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  40.47 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  39.87 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  43.03 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  39.37 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  39.05 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.88 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.65 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.46 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.04 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.16 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  42.16 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.36 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.29 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.81 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  39.19 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  38.91 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  38.05 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.83 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  33.23 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  39.02 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.72 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.58 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  37.66 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  36.55 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.42 
 
 		 302 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  40.48 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.01 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.25 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  40.27 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  37.92 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  32.14 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  32.14 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  32.14 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.41 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.44 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  37.07 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.66 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.34 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  36.84 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>