286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2100 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 
506 aa  1046    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 
524 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 
524 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  41.65 
 
 
524 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  41.7 
 
 
521 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
521 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  41.9 
 
 
521 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
521 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  42.09 
 
 
519 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 
520 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  42.06 
 
 
520 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  41.07 
 
 
520 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  40.16 
 
 
520 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  41.7 
 
 
517 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  41.34 
 
 
518 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  40.51 
 
 
514 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  39.76 
 
 
516 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  39.1 
 
 
531 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  40.51 
 
 
540 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  40.37 
 
 
515 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  39.21 
 
 
528 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  43.28 
 
 
511 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  38.31 
 
 
531 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  37.72 
 
 
540 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
511 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
532 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
532 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  37.84 
 
 
540 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 
715 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  40.81 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.1 
 
 
511 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  34.29 
 
 
502 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 
511 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  34.47 
 
 
516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  31.76 
 
 
511 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34 
 
 
507 aa  253  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  33.99 
 
 
512 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  32.83 
 
 
567 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  32.55 
 
 
507 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 
535 aa  250  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 
509 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.19 
 
 
533 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  34.37 
 
 
511 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  35.79 
 
 
508 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  32.31 
 
 
508 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  31.08 
 
 
511 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  30.65 
 
 
507 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  31.52 
 
 
513 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  33.12 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  31.68 
 
 
515 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 
505 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  32.9 
 
 
512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 
505 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 
505 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 
505 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
505 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 
505 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  31.12 
 
 
511 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 
506 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  32.43 
 
 
552 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 
505 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  32.34 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  31.43 
 
 
506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  32.77 
 
 
552 aa  240  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  31.63 
 
 
514 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  33.9 
 
 
523 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  31.56 
 
 
511 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  32.9 
 
 
504 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  32.9 
 
 
504 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 
505 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  33.19 
 
 
505 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  31.13 
 
 
511 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  30.78 
 
 
507 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  32.22 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  32.44 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  31.33 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 
505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  31.06 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  31.36 
 
 
511 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  32.22 
 
 
508 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  31.91 
 
 
511 aa  233  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  32.35 
 
 
508 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  32.69 
 
 
516 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  30.97 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 
523 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  31.52 
 
 
507 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  31.36 
 
 
511 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  29.84 
 
 
517 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 
507 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  29.41 
 
 
514 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  31.54 
 
 
509 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  29.57 
 
 
511 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  30.45 
 
 
510 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3645  histidine ammonia-lyase  31.4 
 
 
520 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  31.38 
 
 
510 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  30.86 
 
 
523 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.468789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>