More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0838 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  56.48 
 
 		 201 aa  246  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  56.91 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  61.45 
 
 		 197 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  54.97 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  54.45 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  54.97 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  57.65 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  51.81 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  38.92 
 
 		 189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  40.99 
 
 		 189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  39.33 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  37.57 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  34.74 
 
 		 190 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  40.28 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  38.51 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  36.97 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  39.44 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  34.34 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  33.73 
 
 		 185 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  33.73 
 
 		 185 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  32.95 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  31.89 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.46 
 
 		 206 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  37.76 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  37.76 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  37.67 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  36.99 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  34.46 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  35.21 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  35.1 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  35.76 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  34.27 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  30.32 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  29.87 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  29.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  29.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  27.92 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  29.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  29.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  33.59 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  33.59 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  36.07 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  34.81 
 
 		 184 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  27.43 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  23.84 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  29.6 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  28.38 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  29.6 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  32.59 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  29.6 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  27.74 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  25 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  25 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  25 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  32.06 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  23.31 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  32.46 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  24.4 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.68 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  27.85 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  27.08 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  27.41 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.66 
 
 		 457 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  28.68 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  27.21 
 
 		 695 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  25.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  27.94 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  26.92 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.48 
 
 		 671 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  27.16 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.75 
 
 		 483 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  26.56 
 
 		 678 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>