More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2937 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  810    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  42.81 
 
 		 515 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  38.25 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.71 
 
 		 234 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 180 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.34 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.57 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.27 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 		 493 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.65 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.03 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  33.77 
 
 		 745 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  44 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.15 
 
 		 14916 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.96 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  52.7 
 
 		 250 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.25 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.96 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.69 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.32 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  44.09 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  33.96 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.26 
 
 		 1033 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.62 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.53 
 
 		 900 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  46.34 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.26 
 
 		 182 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.62 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.94 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  49.25 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  54.55 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.15 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 234 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 234 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  39.34 
 
 		 325 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 		 146 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  28.43 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.76 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1191 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.78 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 		 189 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.04 
 
 		 194 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.97 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 179 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  46.05 
 
 		 830 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  47.3 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 		 862 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>