50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1445 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 473 aa  977    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.46 
 
 		 1441 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  39.48 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  37.36 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.62 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 234 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 279 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  31.87 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.92 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01510  expressed protein  29.32 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.506842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.59 
 
 		 863 aa  73.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35.17 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  25.19 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  23.88 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  37.08 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.33 
 
 		 1132 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06520  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  26.11 
 
 		 877 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.17 
 
 		 639 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.33 
 
 		 869 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  26.29 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  32.26 
 
 		 673 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 1391 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  33.72 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  37.1 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1167 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32.28 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  28.24 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.71 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  29.73 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.45 
 
 		 705 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.61 
 
 		 853 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.84 
 
 		 982 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  48.65 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  45.45 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.12 
 
 		 801 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  41.86 
 
 		 630 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.46 
 
 		 1091 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  37.5 
 
 		 484 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  31.67 
 
 		 524 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1024 aa  46.6  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.06 
 
 		 972 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  33.33 
 
 		 928 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  29.51 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  33.33 
 
 		 926 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  36.9 
 
 		 1356 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 541 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>