15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06520 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06520  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  891    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02400  conserved hypothetical protein  60.08 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.31 
 
 		 654 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  26.58 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  33.52 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.72 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  24.51 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.62 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  27.31 
 
 		 300 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  25.56 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  26 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.52 
 
 		 1441 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>