17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1979 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  100 
 
 		 399 aa  787    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  55.6 
 
 		 642 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  52.4 
 
 		 654 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  30.99 
 
 		 1441 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  32.24 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  32.24 
 
 		 320 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 		 234 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01510  expressed protein  28.29 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.506842  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.91 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02400  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06520  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01500  expressed protein  26.07 
 
 		 217 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.457491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>