17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4930 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  35.37 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 654 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.87 
 
 		 642 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  31.1 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  28.52 
 
 		 399 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  30.31 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.54 
 
 		 1441 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06520  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.88 
 
 		 473 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01510  expressed protein  27.39 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.506842  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02400  conserved hypothetical protein  24.42 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01500  expressed protein  28.8 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.457491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>