16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03460 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03460  conserved hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  858    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.056245  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03340  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 
301 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2528  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97811  normal  0.381441 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03925  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
279 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15718  normal  0.280487 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07871  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 
234 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104048  normal  0.872612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1979  glycosyl hydrolase 53 protein  25.68 
 
 
399 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5684  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.75 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.354384  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01510  expressed protein  27.7 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.506842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7153  hypothetical protein  26.69 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  26.12 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  25.31 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02400  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00957306  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4930  hypothetical protein  23.91 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13299  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01500  expressed protein  26.34 
 
 
217 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.457491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.41 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  24.29 
 
 
1441 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>