More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2346 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2117  histidine kinase  96.4 
 
 
639 aa  1246    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201889  normal  0.773102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2129  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  94.63 
 
 
652 aa  1237    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2346  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1318    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.15581  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2230  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  98.75 
 
 
639 aa  1304    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0741233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2200  response regulator receiver protein  57.52 
 
 
641 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.934498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2332  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
670 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000360644  normal  0.145039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 
1771 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
932 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1767 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1767 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1782 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  27.37 
 
 
1125 aa  148  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
847 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 
1002 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 
1002 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1009 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
916 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
1126 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1786 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
1574 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1203 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  25.84 
 
 
810 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.42 
 
 
1765 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
862 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
1193 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 
1146 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  29.41 
 
 
987 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
1193 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  26.39 
 
 
1128 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1768 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  28.57 
 
 
576 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1013 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1128 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
1582 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1230 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1016 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1070 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1166 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.01 
 
 
1763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.59 
 
 
2051 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  24.59 
 
 
630 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.13 
 
 
844 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.13 
 
 
844 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  24.59 
 
 
630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
1550 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
1611 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  27.93 
 
 
1179 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1234 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  24.42 
 
 
782 aa  137  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
577 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
575 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 
734 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
1362 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  25.63 
 
 
724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
1245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 
1143 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
1214 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  29.02 
 
 
1177 aa  135  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 
1113 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.84 
 
 
870 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  24.6 
 
 
1200 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.92 
 
 
1195 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1099 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  27.15 
 
 
861 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  26.13 
 
 
858 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
785 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
1130 aa  134  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
1322 aa  134  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
806 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  26.57 
 
 
985 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 
1069 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  28.61 
 
 
1040 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  28.18 
 
 
1286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 
1131 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
1323 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  28.42 
 
 
787 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.19 
 
 
1331 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
925 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 
1820 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 
1126 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
1075 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  27.05 
 
 
1236 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
1266 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
907 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
1165 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 
811 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
631 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  25.51 
 
 
1071 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1287 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
827 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
950 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 
1058 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
934 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  26.96 
 
 
641 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
1124 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>