More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2005 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  99.54 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  94.47 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  94.47 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  94.47 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  94.47 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  94.93 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  94.47 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  94.01 
 
 		 217 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  66.51 
 
 		 206 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  46.83 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  50 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  45.07 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  47.47 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  49.18 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  48.62 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  45.23 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  51.91 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  50.52 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  47.59 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  41.71 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  48.86 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0391  ABC transporter related  36.55 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 367 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.88 
 
 		 363 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 353 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  37.11 
 
 		 353 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  34.62 
 
 		 333 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  36.55 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 339 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.55 
 
 		 339 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  40.33 
 
 		 375 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  34.34 
 
 		 353 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  36.95 
 
 		 269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  41.03 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  36.63 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0252  ABC transporter related  37.1 
 
 		 356 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  39.44 
 
 		 366 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  36.45 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 364 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  38.78 
 
 		 359 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  37.37 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.82 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 352 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 354 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  37.26 
 
 		 357 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  36.32 
 
 		 366 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 		 354 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  37.04 
 
 		 350 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  37.08 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  37.76 
 
 		 363 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  38.19 
 
 		 324 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3244  ABC transporter related  38.97 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 351 aa  122  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  35.32 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.5 
 
 		 389 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  37.76 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  39.11 
 
 		 367 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  38.58 
 
 		 330 aa  121  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 		 377 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  37.31 
 
 		 344 aa  121  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  36.82 
 
 		 375 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  36.73 
 
 		 391 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  34.87 
 
 		 353 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  35.38 
 
 		 353 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  39.89 
 
 		 368 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 333 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  35.91 
 
 		 365 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 351 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  36.63 
 
 		 323 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  36.27 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 		 349 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.65 
 
 		 372 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  38.67 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.61 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  38.43 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  37.62 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.36 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  40.66 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  34.72 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  35.21 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.57 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>