205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0288 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  47.62 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  43.65 
 
 
274 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  43.65 
 
 
274 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  35.13 
 
 
298 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34810  formate/nitrite transporter family protein  36 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  32.03 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  31.25 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 
283 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  31.64 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  30.86 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  31.25 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  31.64 
 
 
262 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  29.8 
 
 
276 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.33 
 
 
277 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  27.2 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  24.03 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  24.8 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  25.4 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  25.18 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  28.34 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  24.6 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  25.18 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  28.74 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  25.59 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  29.3 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  27.11 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  27.17 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  26.67 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  27.11 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  27.11 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  27.11 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  26.67 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  25.24 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  24.54 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  27.11 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  24.7 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  28.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  28.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  28.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  28.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  26.5 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  28.73 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  27.99 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  27.03 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  24.15 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  23.31 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  27.91 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  25.79 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  24.23 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  23.08 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  25.49 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  22.98 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  22.98 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  25.98 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  22.98 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  26.69 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  27.55 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  28.51 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  23.94 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  24.38 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  24.02 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  27.88 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  27.88 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  27.88 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  27.88 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  24.18 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  23.4 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  24.81 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  22.77 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  27.31 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  26.64 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  23.56 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  27.97 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  25.85 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  23.67 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  24.81 
 
 
537 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  25.93 
 
 
491 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  23.19 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  27 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  26.17 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.31 
 
 
483 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  23.35 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  25.93 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>