169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3953 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  45.93 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  45.15 
 
 		 346 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  42.65 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  33.83 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  31.84 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  31.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  37.32 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  29.95 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  30.95 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.16 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.16 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.86 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.54 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  31.58 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.88 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  31.13 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  31.58 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.33 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  26.97 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.6 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  30.23 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  31.75 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  28.71 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  27.5 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  28.4 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28.87 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.49 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  27.36 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.81 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  28.91 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  28.88 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  32 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.17 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  27.4 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  29.67 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  24.44 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  30.24 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  25.82 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  34.69 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  32.85 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  26.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  26.78 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  26.29 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.76 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  22.78 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  28.21 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.95 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  29.05 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.6 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  29.3 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  28.34 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  32.5 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  28.18 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.43 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  23.94 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.68 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.68 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.96 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  27.35 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  22.86 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  28.65 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  25.47 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  26.96 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  25.81 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  26.04 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.67 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  26.26 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  29.03 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  32.35 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  30.84 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  28.37 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  35.82 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  26.38 
 
 		 253 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  27.18 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.7 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  25.56 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  29.12 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  27.68 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  25.14 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  26.29 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  25.96 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>