More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2348 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
399 aa  799    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  64.36 
 
 
402 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  52.58 
 
 
411 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  50 
 
 
410 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  55.31 
 
 
401 aa  342  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  50.68 
 
 
454 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  47.68 
 
 
394 aa  320  3e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  46.73 
 
 
396 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  45.37 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  46.67 
 
 
406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  43.77 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  45.8 
 
 
399 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  44.22 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  46.73 
 
 
429 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.77 
 
 
393 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  42.65 
 
 
423 aa  287  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40.85 
 
 
391 aa  276  5e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  42.45 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  40.41 
 
 
387 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.4 
 
 
390 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.93 
 
 
387 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  44.31 
 
 
398 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.63 
 
 
390 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.56 
 
 
388 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  42.3 
 
 
387 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.05 
 
 
379 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  38.72 
 
 
397 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  40.81 
 
 
388 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  37.69 
 
 
396 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.08 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  41.41 
 
 
387 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  41.56 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  41.56 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.13 
 
 
398 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  41.58 
 
 
399 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.43 
 
 
393 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.67 
 
 
390 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  36.65 
 
 
393 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  40.89 
 
 
396 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  37.31 
 
 
387 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.83 
 
 
385 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  34.86 
 
 
398 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.57 
 
 
385 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  37.44 
 
 
395 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  34.61 
 
 
398 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.28 
 
 
385 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  40.93 
 
 
388 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.35 
 
 
466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  42.41 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.4 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  40.05 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  38.5 
 
 
447 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.38 
 
 
396 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  39.13 
 
 
437 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  40.16 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  38.38 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  40.1 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  39.74 
 
 
424 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  34.92 
 
 
400 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  40.1 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  40.42 
 
 
396 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.64 
 
 
435 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 
407 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  40.58 
 
 
395 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  41.41 
 
 
405 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.08 
 
 
380 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  44.68 
 
 
505 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.54 
 
 
394 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  41.51 
 
 
390 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.79 
 
 
389 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  37.13 
 
 
431 aa  249  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.74 
 
 
388 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.76 
 
 
404 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.3 
 
 
438 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  39.5 
 
 
458 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  40.37 
 
 
395 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.55 
 
 
396 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  38.73 
 
 
395 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.78 
 
 
465 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.99 
 
 
395 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.11 
 
 
394 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  38.46 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.94 
 
 
465 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  39.1 
 
 
404 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  38.85 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  39.05 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  38.85 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  38.85 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.8 
 
 
480 aa  245  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  36.68 
 
 
397 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.06 
 
 
465 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.2 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.76 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  36.44 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>