56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3599 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 407 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  94.84 
 
 		 407 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  59.59 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 410 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 524 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  37.02 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  37.56 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  36.14 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  39.2 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.67 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  33.22 
 
 		 562 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  33.42 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  36.24 
 
 		 527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.71 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  33.89 
 
 		 491 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  34.38 
 
 		 535 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  30.38 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  29.35 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  31.77 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.19 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  25.56 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  29.4 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  26.15 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  26.75 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  33.04 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  32.06 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  36.76 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>