More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1955 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 221 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 248 aa  148  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 		 268 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.95 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  33.97 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  53.17 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 		 280 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  33.65 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  52.59 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 280 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 296 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  34.03 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  41.62 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  42.58 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 288 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.73 
 
 		 270 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  50.44 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  44.44 
 
 		 282 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  39.89 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.96 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 279 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 		 268 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  44.7 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  44.7 
 
 		 273 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.07 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.31 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.31 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.31 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.08 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 285 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 285 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 		 287 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  55.24 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  46.28 
 
 		 306 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 300 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.59 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  45.32 
 
 		 281 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 281 aa  99.4  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 273 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 284 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  42.64 
 
 		 279 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 		 280 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 285 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  40.31 
 
 		 271 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  40.31 
 
 		 271 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 265 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 		 285 aa  98.2  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 		 271 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.45 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.53 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>