201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1762 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  55.16 
 
 		 756 aa  832    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 767 aa  1553    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  57.43 
 
 		 748 aa  863    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  32.5 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 842 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 833 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  28.68 
 
 		 833 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 842 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  28.82 
 
 		 776 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 837 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  27.93 
 
 		 886 aa  270  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  27.38 
 
 		 861 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  28.08 
 
 		 886 aa  266  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  27.24 
 
 		 786 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  28.03 
 
 		 792 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 886 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 876 aa  261  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  28.03 
 
 		 792 aa  260  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  27.96 
 
 		 876 aa  260  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  28.32 
 
 		 786 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 		 831 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 		 780 aa  257  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  27.92 
 
 		 859 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 		 777 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 		 862 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  29.63 
 
 		 746 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  26.54 
 
 		 829 aa  245  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  26.73 
 
 		 784 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  25.49 
 
 		 892 aa  230  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  25.79 
 
 		 791 aa  224  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  28.42 
 
 		 724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  25.47 
 
 		 889 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 		 816 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  25.25 
 
 		 716 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.97 
 
 		 804 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  26.96 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  25.04 
 
 		 714 aa  187  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  25.04 
 
 		 714 aa  187  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  25.87 
 
 		 712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  23.66 
 
 		 715 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.61 
 
 		 822 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.85 
 
 		 819 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  22.61 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  26.53 
 
 		 863 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  24.06 
 
 		 728 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  22.78 
 
 		 860 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  22.79 
 
 		 781 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  29.93 
 
 		 799 aa  111  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  22.05 
 
 		 790 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  30.07 
 
 		 814 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  30.63 
 
 		 791 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1698  putative organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 997 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.999611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  24.84 
 
 		 856 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1519  organic solvent tolerance protein  27.74 
 
 		 912 aa  108  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  25.21 
 
 		 738 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  24.41 
 
 		 774 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  32.88 
 
 		 860 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1754  organic solvent tolerance protein  29.48 
 
 		 1131 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0989736  hitchhiker  0.000198385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.18 
 
 		 836 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  25.05 
 
 		 1091 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  28.62 
 
 		 786 aa  104  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  24.61 
 
 		 820 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  32.69 
 
 		 783 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  25.38 
 
 		 839 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 786 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 786 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.52 
 
 		 786 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  25.16 
 
 		 839 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  26.48 
 
 		 789 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.49 
 
 		 753 aa  98.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  22.94 
 
 		 787 aa  97.4  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  22.26 
 
 		 764 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  28.57 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 761 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  28.11 
 
 		 786 aa  94.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  27.62 
 
 		 762 aa  94.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  25.38 
 
 		 778 aa  94.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.17 
 
 		 810 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.76 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.1 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  26.54 
 
 		 807 aa  93.6  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.61 
 
 		 771 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  27.63 
 
 		 824 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  28.21 
 
 		 799 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 		 686 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 784 aa  92.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  23.63 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  26.75 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  23.86 
 
 		 792 aa  91.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  24.87 
 
 		 757 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  24.27 
 
 		 792 aa  91.3  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>