More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0485 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  57.54 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  64.2 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  53.97 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  55.56 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  53.57 
 
 		 255 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  55.08 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  52.89 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  53.47 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  53.94 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  54.32 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  54.15 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  55.14 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  53.33 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  51.98 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  50.99 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  52.44 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  51.24 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  54.13 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  54.13 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  51.38 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  52.26 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  51.67 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  48.24 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  50.59 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.41 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  49.59 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  51.02 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  49.59 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  46.12 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  43.75 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  47.22 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  44.62 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  41.98 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  51.03 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  48.41 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  48.08 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.99 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.08 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  40.45 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.26 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.29 
 
 		 254 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.09 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.92 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.54 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.06 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40.43 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.5 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  36.58 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.48 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  37.6 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  37.33 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.11 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.11 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.11 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  37.56 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  41.77 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.09 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.23 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  34.73 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.73 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.15 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  31.86 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.55 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  37.89 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  36.91 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.62 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  32.05 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.01 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.09 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  42.15 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  31.82 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  40.17 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.51 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.92 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.02 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  36.21 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  37.93 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  35.63 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.73 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.16 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34.02 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  38.96 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.11 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.18 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.19 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.64 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>