More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1736 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  42.81 
 
 		 873 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  43.48 
 
 		 870 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  48.43 
 
 		 876 aa  822    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  50.96 
 
 		 877 aa  872    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  77.05 
 
 		 880 aa  1395    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 891 aa  871    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 891 aa  871    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 891 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  52.47 
 
 		 878 aa  891    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  42.79 
 
 		 883 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  50.73 
 
 		 877 aa  870    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  43.87 
 
 		 879 aa  702    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 877 aa  870    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43.28 
 
 		 888 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 877 aa  869    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 877 aa  870    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  50.61 
 
 		 876 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.49 
 
 		 885 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  51.92 
 
 		 876 aa  871    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  50.96 
 
 		 877 aa  874    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  44.07 
 
 		 866 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  43.95 
 
 		 866 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 895 aa  734    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  51.19 
 
 		 877 aa  872    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 872 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  50.96 
 
 		 877 aa  867    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 866 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 894 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  50.61 
 
 		 876 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  68.32 
 
 		 877 aa  1224    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  49.83 
 
 		 903 aa  832    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  55.63 
 
 		 896 aa  977    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  51.88 
 
 		 893 aa  867    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  100 
 
 		 879 aa  1798    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  54.22 
 
 		 888 aa  934    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 896 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 868 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 878 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.7 
 
 		 850 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 892 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.37 
 
 		 892 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 891 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.49 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 892 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 892 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.56 
 
 		 901 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 949 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 891 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 924 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 932 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 875 aa  570  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 912 aa  572  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 902 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 893 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 906 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.67 
 
 		 903 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 885 aa  560  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 893 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 909 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 895 aa  559  1e-157  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.25 
 
 		 908 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 920 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 920 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 910 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 929 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 912 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 899 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 908 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 888 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 911 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  38.17 
 
 		 904 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 902 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  37.12 
 
 		 936 aa  550  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 945 aa  552  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 893 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 904 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 903 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 893 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 933 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 901 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 926 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 906 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 937 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 939 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 911 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  36.93 
 
 		 899 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 912 aa  532  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 910 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 929 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 905 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 897 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 928 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 843 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 889 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 994 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 911 aa  521  1e-146  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 915 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 936 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>