104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0962 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0962  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
161 aa  333  5e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.154393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  45.68 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  39.52 
 
 
164 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  39.52 
 
 
164 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  39.52 
 
 
164 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  39.52 
 
 
164 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0843  NUDIX family hydrolase  42.45 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  38.22 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 
164 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  25.98 
 
 
146 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  40.35 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
136 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  26.72 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  26.52 
 
 
473 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  25.95 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
153 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
143 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
301 aa  47.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
152 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  25 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  31.03 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  26.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  29.21 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36.36 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  44.64 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  25.68 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4696  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67554  normal  0.0300067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  31.76 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  44.64 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  26.77 
 
 
362 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  36 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  31.72 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  24.26 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2477  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000509657  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 
361 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2590  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
164 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  normal  0.0536923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
158 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1874  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00903017  hitchhiker  0.00000719314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
142 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2470  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
162 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000173828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  24.18 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2972  mutT/nudix family protein  34.12 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.461644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 
229 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 
158 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  24.48 
 
 
298 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  24.8 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
203 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  35.82 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2443  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2232  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000560671  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  35.59 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
255 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>