More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0015 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  71.11 
 
 		 226 aa  327  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  71.11 
 
 		 226 aa  327  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  53.88 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0198  peptide ABC transporter ATPase  54.26 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  53.15 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  54.05 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.5 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.9 
 
 		 226 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.78 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.79 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.21 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  47.49 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.22 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.2 
 
 		 226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.21 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.67 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  49.32 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.65 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  46.64 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  46.02 
 
 		 707 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.32 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  48.4 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  48.4 
 
 		 253 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  47.95 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.6 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.95 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  47.03 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.25 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 658 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  47.49 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.1 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  43.95 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.13 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.53 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  46.9 
 
 		 250 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  49.04 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.95 
 
 		 254 aa  214  9e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.23 
 
 		 640 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  48.86 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.56 
 
 		 242 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  47.75 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  48.4 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  46.58 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.4 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  46.58 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  46.12 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  46.58 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  46.58 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  46.58 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.3 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  48.4 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  45.98 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  45.33 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.18 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.33 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>