More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2613 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  47.8 
 
 		 205 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.78 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.29 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.8 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 234 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 253 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  47.55 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.8 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.71 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43.54 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.46 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.34 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.35 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  44.61 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.8 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  48.82 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 241 aa  160  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.55 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.66 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.99 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  45.32 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 226 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>