More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1726 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1726  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  61.57 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  59.14 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  59.14 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2324  short chain dehydrogenase  58.91 
 
 		 270 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3773  short chain dehydrogenase  56.32 
 
 		 273 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  58.2 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3485  short chain dehydrogenase  56.7 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.591182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2836  short chain dehydrogenase  55.25 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3912  short chain dehydrogenase  57.31 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1563  short chain dehydrogenase  56.7 
 
 		 273 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26200  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22411  predicted protein  35.88 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1365  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.468892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1425  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.67 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  34.25 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  33.86 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  33.46 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  36.21 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  33.33 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  32.94 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.92 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  32.94 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  33.98 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  33.2 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  33.98 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  32.81 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.75 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  33.2 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.35 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  33.2 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  36.21 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.35 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  34.26 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1458  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  32.41 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  30.35 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  34.68 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 250 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0403  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.43 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.253369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3480  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.43 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.538943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3483  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.43 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>