More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1620 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 366 aa  729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.97 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  52.14 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.69 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  50.71 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  56.46 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.91 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  57.75 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  53.39 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  52.5 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.22 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  52.56 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.26 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  53.06 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  51.54 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  52.1 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  51.54 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.96 
 
 		 367 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  53.46 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.56 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  57.41 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  51.57 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  50.14 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  56.04 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  53.67 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  50.41 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.7 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.56 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  52.54 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  51.27 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.42 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 		 367 aa  362  4e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  54.11 
 
 		 374 aa  361  9e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  53.93 
 
 		 378 aa  360  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  50.55 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  54.81 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.26 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 367 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  52 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  53.05 
 
 		 330 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  51.27 
 
 		 376 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 		 368 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.58 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  49.86 
 
 		 370 aa  358  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.34 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  51.65 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  51.65 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  51.67 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  51.42 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  56.48 
 
 		 317 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  53.44 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.72 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50.83 
 
 		 375 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  51.81 
 
 		 375 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  57.14 
 
 		 312 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  52.34 
 
 		 375 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 326 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.31 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  50.7 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.24 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  57.77 
 
 		 321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>