207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0707 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  295  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  63.45 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  59.73 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  57.43 
 
 
151 aa  178  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  52.41 
 
 
172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  55.86 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  53.69 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  51.72 
 
 
147 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  51.72 
 
 
147 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  53.38 
 
 
156 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  53.42 
 
 
146 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  48.97 
 
 
149 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  51.7 
 
 
146 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  50 
 
 
150 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  51.37 
 
 
146 aa  147  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  51.72 
 
 
164 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  55.03 
 
 
149 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  41.1 
 
 
165 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  35.81 
 
 
172 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  31.91 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  36.03 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  34.48 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  31.17 
 
 
173 aa  90.1  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  31.94 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  33.57 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  33.56 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  31.91 
 
 
202 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  37.24 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  31.08 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  33.57 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  29.17 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.85 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  24.83 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.17 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.97 
 
 
258 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.59 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  33.1 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  30.28 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28.86 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.28 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  27.46 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  36.88 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  35.17 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  32.08 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  27.89 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.47 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1525  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.95 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1643  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.76 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1710  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  31.54 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  30.99 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.14 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  28.17 
 
 
228 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1786  hypothetical protein  30.77 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  27.33 
 
 
211 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  24.31 
 
 
215 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  27.21 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.59 
 
 
227 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  26.85 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  26.95 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  35.29 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  31.72 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  30.07 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  25.69 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.57 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  29.29 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  29.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.47 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  33.33 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  26.85 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  30.22 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  27.59 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  27.34 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  25.87 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  30.5 
 
 
272 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  30.5 
 
 
272 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  29.53 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  29.53 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3665  hypothetical protein  30.23 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1679  hypothetical protein  30.23 
 
 
221 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  21.99 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  25.9 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  24.81 
 
 
228 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  28.26 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  26.06 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>