More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0507 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  825    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  36.09 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.86 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 412 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  33.16 
 
 		 487 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  31.28 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 404 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 410 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  29.81 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  30.93 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  35.82 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  31.23 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  28.02 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  31.74 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  28.02 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  27.57 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  27.03 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  33.24 
 
 		 408 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  33.24 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  33.7 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  32.78 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  32.78 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  32.78 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  32.51 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  32.51 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  29.59 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  25.17 
 
 		 401 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.59 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  24.08 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  30.57 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  25.78 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.51 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.8 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0587  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>