More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0438 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  71.43 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  64.49 
 
 		 245 aa  318  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  33.33 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.47 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  32.68 
 
 		 365 aa  99.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.28 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 376 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  33.19 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.41 
 
 		 377 aa  89.4  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 339 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 339 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  26.88 
 
 		 339 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  26.88 
 
 		 339 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  29.78 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 378 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.26 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  28.96 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  26.25 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  26.25 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.29 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  31.33 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.25 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.65 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.58 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  26.63 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.37 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 384 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.72 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.17 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.74 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  31.25 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.25 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 376 aa  72  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 373 aa  72  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.73 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  32.04 
 
 		 911 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 353 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.62 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.69 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.58 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  25.84 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.94 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  21.61 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  27.12 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  21.61 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  21.61 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>