More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0437 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  825    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  59.55 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  54.81 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  48.88 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  52.71 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  50.25 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  48.64 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  45.61 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  47.1 
 
 		 460 aa  328  8e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  48.72 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  44.47 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  45.06 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  47.38 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  45.98 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  45.64 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  45.23 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.19 
 
 		 416 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  47.43 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  45.09 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  45.11 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  48.06 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  46.91 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  43.18 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  39.95 
 
 		 408 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  42.62 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  45.59 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  43.69 
 
 		 415 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  43.32 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  43.45 
 
 		 421 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  43.77 
 
 		 420 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  45.5 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  45 
 
 		 416 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  41.67 
 
 		 521 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  43.37 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  41.87 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  35.11 
 
 		 404 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  44.07 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  33.75 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.69 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.34 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  32.08 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 533 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  31 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.8 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.17 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.58 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.97 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  26.99 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  31.5 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  29.22 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  29.01 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  32.28 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.51 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  25.48 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.93 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.55 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  27.71 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.61 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  24.09 
 
 		 566 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  31.12 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  31.12 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  31.12 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.94 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.94 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.64 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.94 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  28.44 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.24 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  29.78 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  27.68 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  25.85 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  29.67 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  24.44 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  28.26 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.3 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.08 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  28.57 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  26.09 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  23.6 
 
 		 574 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.89 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  26.1 
 
 		 524 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3622  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.4 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>