More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3638 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
291 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  39.85 
 
 
291 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6501  ABC transporter permease  37.32 
 
 
285 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
290 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
282 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
290 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
290 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
283 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
296 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
290 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  36.11 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  35.85 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
296 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  37.6 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
295 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
274 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
288 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
301 aa  168  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
301 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  37.08 
 
 
293 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
308 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
301 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
301 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
301 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
289 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
301 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
291 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
326 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
284 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0749  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  33.57 
 
 
304 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
274 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
302 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  36.25 
 
 
289 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119366  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
278 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
290 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  35.96 
 
 
300 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
413 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
326 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
299 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
290 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
288 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
302 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
292 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
306 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
283 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
301 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  36 
 
 
317 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  37.98 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1835  ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
669 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  34.62 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.35 
 
 
314 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
301 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.76 
 
 
306 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.95 
 
 
288 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
302 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
299 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  33.91 
 
 
303 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  34.78 
 
 
297 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.33 
 
 
282 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.33 
 
 
282 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
293 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
416 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
282 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
282 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.62 
 
 
319 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
306 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
306 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  34.78 
 
 
297 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
323 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
283 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
283 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
296 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>