More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0643 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.15 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  53.72 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  50.98 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  51.57 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  50.4 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  51.59 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  51.37 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  50.2 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  49.8 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  50.41 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  49.01 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  51.43 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  50.59 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  49.21 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  50.39 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.11 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  49.8 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  50.2 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  49.79 
 
 		 264 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  49.41 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  49.8 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  48.96 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  48.96 
 
 		 265 aa  231  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  48.55 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  50.62 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  48.35 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  52.46 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  43.15 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  48 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  50.61 
 
 		 257 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  49.61 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  48.77 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  48.21 
 
 		 247 aa  204  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  50.41 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  48.22 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  48.63 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  49.19 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  41.83 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.43 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  37.45 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  35.74 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  35.32 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.92 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  37.8 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.02 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  35.8 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  36.97 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.39 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.14 
 
 		 263 aa  128  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  35.71 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  36.15 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.87 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  37.02 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.29 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.22 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.6 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.29 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.6 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  32.91 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.6 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  31.76 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  37.55 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  34.96 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  32.26 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  37.4 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.17 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.17 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.17 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  34.44 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  35.57 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  33.6 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.46 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  35.54 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  34.82 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  32.63 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.77 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  34.02 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  38.74 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.12 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  34.54 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  34.94 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  34.51 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.11 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  36.56 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  32.6 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  35.54 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  35.74 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  35.74 
 
 		 243 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  38.14 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>