More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3123 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  87.76 
 
 		 572 aa  1011    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  56.83 
 
 		 603 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  63.59 
 
 		 573 aa  757    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  74.56 
 
 		 573 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  65.74 
 
 		 610 aa  784    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  68.52 
 
 		 576 aa  831    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  66.43 
 
 		 571 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  65.21 
 
 		 574 aa  755    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  75.78 
 
 		 574 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  98.43 
 
 		 573 aa  1144    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  64.31 
 
 		 580 aa  777    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  66.55 
 
 		 571 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 573 aa  1162    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  68.52 
 
 		 576 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  54.66 
 
 		 577 aa  673    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  55.2 
 
 		 596 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  51.25 
 
 		 600 aa  646    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  66.9 
 
 		 575 aa  786    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  66.96 
 
 		 570 aa  769    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  54.25 
 
 		 586 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  53.7 
 
 		 585 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  55.29 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  54.01 
 
 		 583 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  53.62 
 
 		 592 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  50 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.21 
 
 		 581 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  52.83 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  46.07 
 
 		 636 aa  552  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  50.7 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.91 
 
 		 564 aa  554  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  50.17 
 
 		 564 aa  551  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  50 
 
 		 563 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  49.65 
 
 		 578 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  50 
 
 		 563 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  49.83 
 
 		 565 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.71 
 
 		 578 aa  535  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  50.18 
 
 		 559 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  44.33 
 
 		 577 aa  495  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.59 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.84 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  36.27 
 
 		 579 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  39.47 
 
 		 572 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  33.58 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  32.45 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 479 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  30.37 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  31.17 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.85 
 
 		 595 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  29.18 
 
 		 577 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.18 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 508 aa  143  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.4 
 
 		 530 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.84 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.63 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.4 
 
 		 523 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.63 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.27 
 
 		 594 aa  120  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.63 
 
 		 518 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.43 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.14 
 
 		 713 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.2 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  27.44 
 
 		 546 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 1284 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.57 
 
 		 515 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.49 
 
 		 659 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.16 
 
 		 546 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.55 
 
 		 517 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.66 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  25.73 
 
 		 546 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.43 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.22 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25.22 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 533 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.51 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.72 
 
 		 687 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.29 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.54 
 
 		 539 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  25.3 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  24.03 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.72 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.51 
 
 		 1175 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.24 
 
 		 489 aa  96.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  27.33 
 
 		 590 aa  95.9  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.51 
 
 		 1181 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  27.84 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.66 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.41 
 
 		 627 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  27.59 
 
 		 500 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.84 
 
 		 547 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.48 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  27.12 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.25 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.01 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.18 
 
 		 1202 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  28.38 
 
 		 633 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.9 
 
 		 1215 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.91 
 
 		 558 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>