More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0323 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  98.83 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  81.64 
 
 		 257 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  80.31 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  80.31 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  79.13 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  78.35 
 
 		 260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  71.79 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  68.57 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  70.8 
 
 		 258 aa  348  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  72.96 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  66.53 
 
 		 262 aa  339  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  64.54 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  72.96 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  69.57 
 
 		 266 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  67.95 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  67.95 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.7 
 
 		 255 aa  322  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  67.38 
 
 		 257 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.84 
 
 		 568 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 		 623 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 		 594 aa  175  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 610 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 610 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 619 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 619 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 619 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 629 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 		 573 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 		 573 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 606 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  38.71 
 
 		 558 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 585 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  42.32 
 
 		 567 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.4 
 
 		 552 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 606 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.08 
 
 		 563 aa  165  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 		 568 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 571 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.56 
 
 		 575 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 		 575 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 568 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 567 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  40.5 
 
 		 593 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 572 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 572 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  38.25 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 244 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 567 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.33 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  37.14 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.47 
 
 		 535 aa  135  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 		 536 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 401 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  31.05 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  32.63 
 
 		 389 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 377 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.65 
 
 		 397 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 399 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.78 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 386 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.3 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.8 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.48 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  41.76 
 
 		 451 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  35.78 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  35.78 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  35.78 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  29.19 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  42.86 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 314 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1376  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0850607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>