More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4192 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  74.63 
 
 		 476 aa  705    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  82.39 
 
 		 491 aa  768    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  78.79 
 
 		 481 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 474 aa  957    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  83.47 
 
 		 482 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  76.36 
 
 		 477 aa  717    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  77.34 
 
 		 469 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.92 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.71 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.52 
 
 		 499 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.41 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.41 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.23 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.78 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.06 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.73 
 
 		 418 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.7 
 
 		 525 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.49 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.68 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.23 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.48 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  57.39 
 
 		 498 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.38 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.14 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.65 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.56 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.89 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.73 
 
 		 479 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.07 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  54.03 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.44 
 
 		 492 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.18 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  53.65 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.95 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.98 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.27 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.55 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.59 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.32 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.33 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  47.63 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.75 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.32 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.76 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.98 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.24 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.4 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  47.48 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.11 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.2 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.78 
 
 		 550 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  47.38 
 
 		 635 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.61 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.2 
 
 		 628 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.05 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.93 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.78 
 
 		 533 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  49.89 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.1 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  53.1 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.87 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.02 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.6 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.93 
 
 		 560 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  53.87 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.42 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  50.63 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.08 
 
 		 626 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  52.61 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  50.63 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.97 
 
 		 522 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.63 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  49.42 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.57 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  50.63 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  50.63 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.37 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  46.56 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.8 
 
 		 626 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  50.78 
 
 		 574 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  52.57 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.08 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.05 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.76 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.28 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.72 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.78 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.35 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.49 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.93 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  51.99 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.8 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  51.61 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.65 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.82 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.41 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>